Ciao.
Io adopero Lilypond:
http://lilypond.org/Secondo me è un programma molto ben fatto, ed è gratuito. Purtroppo non è facilissimo da imparare, perché non è WYSIWYG. Questo significa che non si vede lo spartito man mano che lo si scrive, ma si scrive un file di testo, tipo:
{do re mi fa}
poi si compila il file, cioè lo si fa processare dal programma, e lui sforna il pdf con il tuo spartito.
Io ho iniziato con questo, non ho provato altri programmi perché mi sono subito trovato bene e con risultati di grandissima qualità. Se ti serve aiuto, sono disponibile.
Massimo